Bazy do bajtów

Koszt sekwencjonowania ludzkich genomów gwałtownie spada — w najbardziej zaawansowanych centrach genomiki spada pięciokrotnie szybciej niż koszt obliczeń. Coraz częściej ludzie sekwencjonują swoje DNA przez firmy i laboratoria badawcze w poszukiwaniu wskazówek dotyczących zmienności genetycznej i chorób.

Ale branża musi wymyślić, jak tanio przechowywać wszystkie uzyskane dane. Każda z 3,2 miliarda par zasad DNA w ludzkim genomie może być zakodowana przez dwa bity — 800 megabajtów dla całego genomu. Ale spore dane o każda baza jest zwykle zbierana, a geny są często sekwencjonowane wiele razy, aby zapewnić dokładność, więc często oszczędza się około 100 gigabajtów podczas sekwencjonowania ludzkiego genomu za pomocą maszyny wykonanej przez lidera branży Illuminę. Przechowywanie tak dużej ilości danych o każdej osobie na świecie wymagałoby mniej więcej takiej ilości pamięci cyfrowej, jaka była dostępna na całym świecie w 2010 roku.

Ta historia była częścią naszego wydania z maja 2012 r.

• Zobacz resztę numeru
• Subskrybuj

Sztuką będzie więc oszczędzać mniej. Genetyk z Harvardu, George Church, mówi, że ostatecznie trzeba będzie przechowywać tylko różnice między nowo zsekwencjonowanym genomem a genomem referencyjnym. Ta informacja może być zakodowana w zaledwie czterech megabajtach. Wtedy twój genom może być tylko kolejnym załącznikiem do e-maila.

Grafika informacyjna Infographics.com

ukryć