211service.com
Brytyjski rząd wybiera Illumina do sekwencjonowania 100 000 genomów
Brytyjski rząd twierdzi, że planuje zatrudnić amerykańską firmę Illumina zajmującą się sekwencjonowaniem genów, aby zsekwencjonowała 100 000 ludzkich genomów w ramach największego krajowego projektu dekodowania DNA populacji.
Maszyna genowa: Instrument do sekwencjonowania firmy Illumina może zdekodować genom w ciągu jednego dnia.
w zgłoszenie regulacyjne z amerykańską Komisją Papierów Wartościowych i Giełd Illumina powiedziała, że została wybrana jako preferowany partner do projektu wartego 100 milionów funtów.
Firma Genomics England potwierdziła, że do realizacji projektu sekwencjonowania wybrała firmę z Kalifornii. Przeszliśmy przez proces „pieczenia”, aby znaleźć odpowiednią firmę do przeprowadzenia sekwencjonowania, a teraz przystępujemy do szczegółowych negocjacji, mówi Vivienne Parry, rzecznik Genomics England.
Instrumenty sekwencjonowania firmy Illumina dominują na rynku odkrywania DNA (patrz 50 najmądrzejszych firm). Parry mówi, że o to stanowisko ubiega się mniej niż pięć innych firm, jeden z największych projektów sekwencjonowania, jakie kiedykolwiek podjęto.
Niektóre inne kraje również rozważają duże krajowe projekty sekwencjonowania. Projekt w Wielkiej Brytanii skupi się na osobach chorych na raka, a także dorosłych i dzieci z rzadkimi chorobami. Ponieważ wszyscy Brytyjczycy są członkami National Health Service, projekt oczekuje, że będzie w stanie porównać dane DNA ze szczegółowymi scentralizowanymi dokumentami zdrowotnymi (patrz Dlaczego Wielka Brytania chce Genomowej Narodowej Służby Zdrowia).
Podczas gdy liczba genomów do zsekwencjonowania wynosi 100 000, całkowita liczba Brytyjczyków biorących udział w badaniu jest mniejsza i wynosi około 70 000. Dzieje się tak, ponieważ dla pacjentów z rakiem Genomics England zamierza uzyskać sekwencję zarówno ich odziedziczonego DNA, jak i sekwencji nowotworowych.
Genomics England zaczął rozmawiać na początku tego roku z potencjalnymi oferentami, w tym z chińską firmą i rywalem Illumina, BGI (patrz Inside China’s Genome Factory). W tym czasie średni koszt ukończenia genomu wynosił około 3000 do 4000 dolarów.
Skompletowanie wszystkich 100 000 genomów kosztowałoby ponad dwukrotnie budżet Genomics England. Agencja poinformowała w grudniu, że zamierza wykorzystać swoją siłę negocjacyjną do obniżenia cen.
Illumina zareagowała, wypuszczając nowy system, Hiseq X Ten, który, jak mówi, byłby w stanie sekwencjonować genomy za 1000 USD każdy, przekraczając długo oczekiwaną barierę cenową (patrz Czy Illumina ma pierwszy genom o wartości 1000 USD?).
Ten system to w rzeczywistości 10 maszyn, z których każda kosztuje milion dolarów. Wymagając od kupujących zainwestowania co najmniej 10 milionów dolarów w sprzęt, Illumina upewniła się, że niższe koszty nowego systemu nie wpłyną znacząco na ceny w innych częściach rynku sekwencjonowania, jednocześnie pozwalając na zdobycie dużych krajowych miejsc pracy, takich jak ta w Wielkiej Brytanii.
Według użytkowników nowego systemu Illumina cena za genom jest nadal bliższa 2000 USD niż 1000 USD.
Parry mówi, że Illumina przeprowadzi sekwencjonowanie w imieniu Genomics England i że obaj sfinalizują negocjacje w ciągu najbliższych dwóch tygodni. To niezwykle ekscytujący projekt, który znajduje się na granicy technologii. To nie jest coś, co ludzie robili wcześniej, mówi Parry. Będziemy na granicy technologii.
[Aktualizacja 7.12.14: Illumina przeprowadzi sekwencjonowanie w imieniu Genomics England 100 000 genomów. Wcześniejsza wersja tego artykułu błędnie mówiła, że Genomics England zamierzała zsekwencjonować DNA 100 000 różnych osobników i że zrobi to sama za pomocą instrumentów zakupionych od Illumina.]