Genom o wartości 1000 USD w dwie godziny do 2012 r., mówi dyrektor generalny Ion Torrent

Jonathan Rothberg, dyrektor generalny firmy zajmującej się technologią sekwencjonowania Ion Torrent, powiedział podczas konferencji Emerging Technology MIT, że mityczny genom o wartości 1000 USD jest już prawie na nas. Jeśli jego przewidywania się spełnią, będzie to zdumiewający triumf w szybkim rozwoju technologicznym. Tempo, w jakim sekwencjonowanie genomu stało się bardziej przystępne, wynosi szybciej niż prawo Moore'a . (Możesz przeczytać pytania i odpowiedzi DZIECI zrobiłem z Rothbergiem na początku tego roku tutaj , a profil jego firmy tutaj ).

Jonathan Rothberg, szef Ion Torrent, przemawia na targach EmTech 2011

Do tego czasu w przyszłym roku zsekwencjonowanie ludzkich genomów będzie równie szybkie i tanie jak genom bakteryjny, powiedział Rothberg. (Wcześniej skomentował, że jego firma może teraz wykonać cały genom bakteryjny w około dwie godziny).

Byłem w pokoju 19 października, kiedy to powiedział, i pomyślałbym, że to czysta pycha, gdyby nie niesamowite osiągnięcia Rothberga w tej dziedzinie, od założenia odnoszącej sukcesy firmy sekwencyjnej poprzedniej generacji 454 Life Sciences do ostatnich przełomów dokonanych dzięki ta sama technologia, którą proponuje, doprowadzi nas do genomu za 1000 dolarów.

Ta technologia, zwana, zwana Osobista maszyna genomowa , jest już używany do określenia jakie mutacje są obecne w genomach nowotworów pacjentów .

Personal Genome Maker pojawia się już w laboratoriach klinicznych, a nawet gabinetach lekarskich

Kluczem do tego przełomu, mówi Rothberg, jest to, że PGM nie opiera się na konwencjonalnej mokrej chemii do sekwencjonowania DNA. Zamiast tego działa prawie w całości konwencjonalna technologia mikroprocesorowa , co oznacza, że ​​Ion Torrent wykorzystuje dziesięciolecia inwestycji w konwencjonalne tranzystory i chipy.

Jak więc wygląda wiek genomu wartego 1000 dolarów? Dopóki nie dowiemy się, z czym więcej z tych genów faktycznie koreluje, dla większości z nas nie będzie to tak bardzo różniło się od teraźniejszości.

W tej chwili nie ma zbyt wielu korelacji między tymi 3 miliardami par zasad [ludzkiego genomu] a wynikami lub lekami, mówi Rothberg. Przewiduje, że przeprowadzenie eksperymentów klinicznych z pełnym sekwencjonowaniem genomu zajmie co najmniej 10 lat, aby doprowadzić nas do punktu, w którym będziemy mogli zacząć odkrywać jego wartość.

I minie 20 lat, zanim zrozumiemy raka na tym samym poziomie co HIV i będziemy mogli opracować kombinacje leków [dopasowane] dla każdej osoby, mówi Rothberg.

Możesz obejrzeć pełny film z jego wykładu na stronie EmTech Tech Review.

ukryć